2. Bayezid döneminin tanınmış mimarlarından, Mimar Hayreddin tarafından 1488’de inşa edilen, tarihi ibadethane zaman içerisinde yol genişletme çalışmaları ve yangın nedeniyle tahrip olurken, 1898’de 2. Abdülhamid tarafından tuğladan restore ettirildi. Osmanlı’nın son döneminde titizlik ve büyük zahmetlerle elden geçirilen eser, zaman içerisinde çevresindeki binalar ve cadde üzerinde olmasından dolayı güçlükle fark edilir hale geldi.
Mimar Hayreddin Cami'nin altında zamanla işyerleri açılırken, camekan kısımlara sonradan monte edilen uyumsuz pimapenler yapıyı gölgede bırakacak bir manzara yarattı. Milliyet'ten Mert İnan'ın haberine göre; dükkanların alarm cihazları gelişigüzel ve izinsiz olarak tarihi eserin duvarlarına monte edildiği dikkatlerden kaçmazken, ibadethanein orijinal dokusunun zarar gördüğü anlaşılıyor.